Но специалисты были разочарованы, ибо надеялись, что канон сформировался ранее IV века. Например, знаменитый «Канон Муратори» (ок. 200 г.) перечисляет почти все известные нам книги за исключением посланий Иакова, Петра и послания к евреям (которые считались сомнительными по своему происхождению). Под большим вопросом был также Апокалипсис (свв. Дионисий Александрийский, Кирилл Иерусалимский и др. не доверяли ему).

Иппонийский Собор 393 г. впервые канонизировал для западных христиан настоящий состав Нового Завета. А на востоке Синайский кодекс IV века также содержал все известные ныне канонические книги, но прибавлял к ним послание ап. Варнавы и Пастырь Гермы. Александрийский кодекс V века добавлял 1-е и 2-е послания Климента. Вообще добавления бывают самые неожиданные (апокалипсис Петра, Дидахе). Из того, что на Константинопольском Соборе 532 г. ещё пытались добавить даже (Псевдо-) Дионисия Ареопагита, можно сделать вывод, что восточный канон сформировался только в VI веке (точнее – на Трулльском Соборе 692 г).

Но западный канон был окончательно установлен ещё позже – на Тридентском Соборе 1546 г. Поэтому не удивительно, что Лютер ещё оспаривал аутентичность послания Иакова (с враждебными его доктрине «оправдания только верою» словами «Вера без дел мертва»). И одновременно заявлял, что базируется только на Писании, а не на достижениях Церкви (которая это Писание, наконец, вычленила и канонизировала).