разница описана в Новом завете.
рождение свыше происходит от слышания проповедуемого в силе Святого Духа слова Бога.
а крещение Святым Духом даётся по вере уже спасённым и рождённым свыше людям.
эта некая "вторая ступень", когда рождённый свыше человек, становясь начатком творения Бога: Он, восхотев, родил нас словом истины, чтобы нам быть неким начатком Его созданий.Иакова 1:18
наделяется силой Святого Духа для проповеди о Христе Иисусе: Но вы примете силу, когда найдет Святой Дух на вас, и вы будете Моими свидетелями и в Иерусалиме, и во всей Иудее и Самарии, и до предела земли
Деяния 1:8